A Compendium of Bona Fide Reference Markers for Genuine Plant Extracellular Vesicles and Their Degree of Phylogenetic Conservation.
研究背景
植物来源的细胞外囊泡（PEVs）研究增长迅速，但缺乏符合MISEV指南的标准参考标记物，本研究旨在为此提供基础。
方法速览
- 样本收集：用真空渗透法从拟南芥和甘蓝叶片提取胞间液，超滤和SEC法分离PEVs。
- 蛋白质组学分析：用LC - MS/MS技术鉴定蛋白并算丰度。
- 功能富集分析：用STRING和Cytoscape软件筛选潜在标记物。
- 正交同源物搜索：用BLASTP工具在UniProt数据库搜索，构建系统发育树评估保守性。
主要发现
潜在的PEV标记物家族
- 水通道蛋白（如PIP21和PIP12）、液泡型ATP酶复合体亚基（如VATB1和VATA）、类Fasciclin阿拉伯半乳糖蛋白（如FLA10和FLA13）等在PEVs中高度富集。
- Syntaxins（除PEN1）、Germin - like proteins（如GL33）、Calreticulins在PEVs中也有富集。
蛋白质的保守性和植物特异性
- 植物特异性标记物：FLA10、FLA13和GL33无动物同源物，在植物界保守性与哺乳动物标记物在动物界相当。
- 跨植物和动物界保守性：VATB1和VATA等在植物和动物界保守性较高。
标记物的选择标准
标记物应具备存在性、特异性、保守性和植物特异性。
总结展望
本研究提供了全面的PEVs蛋白质组数据和新的候选标记物，但仍需进一步实验验证其在不同植物物种中的适用性和特异性。