Single - cell RNA sequencing reveals transcriptomic landscape and potential targets for large/giant congenital melanocytic nevi.
研究背景
大型/巨型先天性黑色素痣(L/GCMN)发病机制不明,治疗挑战大且无统一指南,单细胞技术也未用于其研究,阻碍细胞水平理解。本研究旨在用单细胞和转录组学分析揭示转录组景观,探索关键分子机制及细胞相互作用。
方法速览
采用单细胞RNA测序(scRNA - seq)和批量RNA测序(bulk RNA - seq),结合免疫组化、多重免疫荧光、Western Blot和qRT - PCR等技术,还构建TBX2过表达和敲低的原代黑色素细胞系。
主要发现
- TBX2是核心转录因子:TBX2在L/GCMN黑色素细胞亚群高表达,与增殖和黑色素合成密切相关,在患者皮肤组织显著上调,尤其躯干部位病变。表明其可能是重要驱动因素,表达与结节严重程度和解剖位置有关。
- PTN - PTPRZ1信号通路异常激活:L/GCMN中黑色素细胞间细胞间通信增强,PTN - PTPRZ1信号通路输入输出水平提高,PTN和PTPRZ1表达上调,该通路异常激活可能促进黑色素细胞过度增殖。
- IGF1 - IGF1R信号轴显著增强:L/GCMN中纤维母细胞与黑色素细胞间IGF1 - IGF1R信号轴增强,IGF1在纤维母细胞、IGF1R在黑色素细胞中表达上调,可能通过旁分泌机制推动病理进展。
- TBX2影响黑色素细胞:过表达TBX2促进黑色素细胞增殖和黑色素合成,敲低则抑制,证实其关键作用,可能是治疗靶点。
总结展望
本研究首次用单细胞测序揭示L/GCMN转录组景观,识别TBX2为核心转录因子,揭示信号通路异常激活。但样本量有限,TBX2关键相互作用网络待研究,信号通路干扰效果未验证。