The Change of Noncoding RNA Expression in Olfactory Bulb of Hepatic Encephalopathy Mouse Model: Transcriptomic Analysis and Cellular Analysis.
研究背景
肝性脑病(HE)是与肝功能障碍相关的神经精神疾病,主要由氨毒性引发神经炎症和认知缺陷。近期研究显示,嗅觉功能障碍或为HE早期指标,与氨诱导的脑部神经毒性有关。本研究旨在通过转录组和细胞分析,探究HE小鼠模型中嗅球非编码RNA表达的变化。
方法速览
- 用OBC1嗅球细胞系模拟高氨环境。
- 用JC - 1荧光探针测线粒体膜电位。
- 用DCF - DA荧光探针测细胞内ROS水平。
- 用细胞因子阵列分析细胞因子分泌。
- 提取RNA进行转录组测序和功能分析。
- 用Western Blot分析检测蛋白质表达水平。
- 用免疫细胞化学检测细胞凋亡标志物表达。
主要发现
- 氨毒性致嗅球细胞多方面病理变化:氨暴露破坏OBC1嗅球细胞线粒体功能,激活自噬,增加ROS水平,诱导细胞凋亡,还增加促炎细胞因子分泌。
- BDL手术改变嗅球组织基因表达:转录组分析显示,BDL小鼠嗅球中229个蛋白编码基因、82个lncRNA和36个circRNA显著改变,涉及线粒体、突触等功能类别。
- 不同脑区及不同模型基因表达比较:BDL小鼠嗅球和大脑皮层中37个蛋白编码基因一致改变,免疫相关通路显著富集;BDL小鼠和HFD小鼠嗅球中33个基因一致改变,Ttr可能起关键作用。
总结展望
本研究首次系统分析HE小鼠模型嗅球非编码RNA表达变化,结合细胞实验和转录组分析多层面验证氨毒性细胞病理效应,还通过跨区域比较揭示不同脑区共同分子机制。但存在功能验证不足、缺乏行为学和体内功能研究的局限。