Plasma Microbial Cell-free DNA Metagenomic Sequencing for Diagnosis of Invasive Fungal Diseases Among High-risk Outpatient and Inpatient Immunocompromised Hosts.
研究背景
侵袭性真菌病（IFD）在免疫功能低下患者中是严重临床问题，现有诊断测试费时且具侵入性，因此急需开发新的微创诊断工具。本研究旨在评估微生物细胞游离DNA（mcfDNA）宏基因组测序作为IFD诊断工具的有效性和实用性。
方法速览
采用病例对照设计，利用前瞻性收集并存档的血浆标本和数据，研究对象为接受造血干细胞移植、实体器官移植和强化化疗的血液恶性肿瘤患者。标本在 -80°C 保存，解冻后送实验室进行 mcfDNA 宏基因组测序。
主要发现
- 整体敏感性和特异性：纳入65名确诊或疑似IFD患者和65名对照患者，mcfDNA测序整体敏感性47.7%，特异性100%。
- 不同疾病状态下的敏感性：确诊IFD患者中敏感性为60.0%，疑似患者中为37.1%。
- 不同病原体的敏感性：对侵袭性毛霉病敏感性100%，对侵袭性曲霉病仅45.7%。
- 与其他诊断方法的比较：mcfDNA测序能识别出16.9%常规诊断方法未检测到的真菌病原体，而常规方法也报告了58% mcfDNA未检测到的真菌。
总结展望
mcfDNA测序在诊断IFD方面特异性高，在减少侵入性采样上有潜在价值，检测侵袭性毛霉病敏感性高，还能识别常规方法未检测到的病原体。但也存在敏感性低、样本量有限、时间延迟、单一中心数据及与其他方法对比受限等问题，仍需进一步优化。