Spatial Profiling Identifies Regionally Distinct Microenvironments and Targetable Immunosuppressive Mechanisms in Pediatric Osteosarcoma Pulmonary Metastases.
研究背景
骨肉瘤是儿童、青少年及年轻成人常见恶性骨肿瘤,尤其在转移性疾病中临床挑战大。目前对转移性骨肉瘤微环境免疫抑制机制研究缺乏,本研究旨在通过空间转录组学分析揭示这些机制并找潜在治疗靶点。
方法速览
- 从儿科骨肉瘤患者肺转移灶取FFPE标本,做病理学评估和质量控制。
- 用Visium CytAssist平台进行空间转录组学分析,生成基因表达数据。
- 用Seurat、STDeconvolve等工具处理分析数据,包括基因集富集分析等。
- 通过免疫组化和成像质谱流式技术验证基因和蛋白表达结果。
主要发现
- 区域特异性微环境:转移性骨肉瘤肺转移灶有类似异物肉芽肿的保守空间基因表达模式,由多个区域特异性免疫抑制微环境组成。
- 免疫抑制机制:外周有强烈炎症信号;肿瘤核心周围有纤维胶原包封;肿瘤内部缺乏T细胞浸润,形成免疫沙漠。
- 潜在治疗靶点:CXCR4在肿瘤周围区域表达丰富,与不同配体相互作用,其表达高的患者预后差,可作评估预后生物标志物。
- 信号传导特点:TGFβ信号传导在各区域广泛存在,BMP6和BMP7活性集中在肿瘤内部;IFNγ和TNFα活性在肿瘤周围非恶性组织中。
总结展望
本研究首次用空间转录组学解析转移性骨肉瘤肺转移灶区域特异性微环境,发现多种免疫抑制机制及潜在治疗靶点。不过样本量小、分辨率有限且缺乏功能验证,后续需扩大样本、提高分辨率并做体内实验。