Insights from Single-cell Omics: Cellular Heterogeneity as a Foundation of Clinical Outcome in Chronic Myeloid Leukemia.
关键词: 慢性髓系白血病, 细胞异质性, 单细胞组学
简介: 单细胞组学揭示慢性髓系白血病细胞异质性及对临床结局影响，提出治疗优化策略。
研究背景
慢性髓系白血病（CML）由BCR::ABL1融合基因驱动，虽BCR::ABL1酪氨酸激酶抑制剂（TKIs）治疗有成效，但患者临床结局和不良事件差异大。单细胞组学显示细胞异质性对CML临床结局很重要，本文探讨其揭示的细胞异质性基础并提出治疗优化策略。
方法速览
- 单细胞转录组测序（scRNA - seq）：分析单个细胞转录组，揭示细胞异质性和分子特征。
- 单细胞多组学分析：结合多种模态数据，全面表征细胞。
- 计算生物学工具：如CITE - seq、CellPhoneDB等，用于数据处理等。
主要发现
- 细胞异质性影响TKI治疗反应
CML患者诊断时就存在细胞异质性，如BCR::ABL1 + 克隆生长速率等因素决定治疗效果个体差异。细胞异质性是患者对TKI治疗反应不同的重要基础。
- 慢性期与急变期的细胞特征差异
慢性期（CP）和急变期（BC）患者细胞特征有显著差异。CP患者LSCs有红系分化特征，BC患者LSCs有炎症特征、额外突变和早期祖细胞扩增。细胞特征差异可预测患者是否进展到BC。
- 免疫细胞在TFR维持中的作用
深反应者中活跃的自然杀伤细胞（NK细胞）和调节性T细胞（Tregs）多，更易维持无治疗缓解（TFR）。停TKI治疗后，长期维持TFR患者NK细胞活性增加。免疫细胞组成和活性对TFR维持起关键作用。
- 供者淋"... existing code ... DLI响应者和非响应者在基线T细胞多样性等方面有显著差异。基线T细胞多样性是DLI成功的潜在决定因素，DLI成功依赖患者自身免疫系统状态。
总结与展望
本文创新性地整合单细胞组学数据，揭示CML患者细胞异质性多层次特征并提出治疗优化策略。但研究样本少，需大规模队列验证，且单细胞组学技术复杂、成本高，限制了临床应用。