Single-cell transcriptional responses of T cells during microsporidia infection.
研究背景
微孢子虫是细胞内寄生原生动物，可感染多种宿主，免疫正常个体多呈亚临床状态，免疫低下者会致病。T细胞尤其CD8⁺ T细胞对防微孢子虫扩散重要，但不同T细胞亚群具体作用和功能不明。本研究用单细胞RNA测序（scRNA - seq）分析小鼠脾脏T细胞转录组变化。
方法速览
- 用单细胞RNA测序分析感染和对照组小鼠脾脏T细胞转录组变化。
- 用EasySep™ Mouse T Cell Isolation Kit通过免疫磁珠负选择法分离T细胞。
- 用Seurat软件进行数据处理与分析。
主要发现
- 感染后T细胞亚群变化
- 效应T细胞亚群（Th1、Tfh、效应CD8⁺ T细胞和增殖CD8⁺ T细胞）显著激活并扩增。Th1和Tfh细胞分别上调Ifng和Il21基因表达。
- 检测到高表达Csf1的Th1细胞亚群（Th1_2），可能促巨噬细胞分化和存活。
- CD4⁺ T细胞响应
- Th1_1和Th1_2均高表达Ifng，但Th1_2特异表达Csf1，功能可能有差异。
- IL21⁺ Tfh细胞比例从0.9%增至7.1%，表明其在感染中被激活，参与多种免疫反应。
- CD8⁺ T细胞响应
- 效应CD8⁺ T细胞高表达Gzma和Gzmb，具细胞毒性，Gzma可能在诱导中更重要。
- 增殖CD8⁺ T细胞高表达细胞周期相关基因，具显著增殖能力。
- 非常规T细胞响应
γδ T细胞虽未显著扩增，但表达多个与MHC I相关基因，可能直接参与对微孢子虫识别和响应。
总结与展望
本研究首次详细描述微孢子虫感染后T细胞亚群转录组变化，发现新Th1细胞亚群。不过，研究存在感染模型、时间点选取和样本池化问题，后续需优化模型、增加时间点以全面了解T细胞在不同感染阶段的动态变化。